Эта команда защищает Селение в чрезвычайных ситуациях, исполняя миссии высокого риска на вражеских территориях, и противостоит ниндзя Саннин S-уровня. Они также несут ответственность за запросы на убийство и за миссии, для которых требуются ниндзя с особыми навыками. Все члены АНБУ, как и большинство персонажей в «Naruto», носят с собой Ниндзято, которые обычно прикрепляется к спине, также все они прекрасно разбираются в анатомии человеческого тела.
Используя Технику Временного ПараличаКанасибари но Дзюцу члены команды особого назначения могут обездвижить противника, оставляя их уязвимыми для атаки. С Техникой Аннулирования Времен Дзигяку но Дзюцу АНБУ может поместить кого-либо в состояние гипноза, заставляя вспомнить определённые детали из их жизни.

AНБУ находится под прямым контролем Кагэ. Хатакэ Какаши однажды был капитаном этой команды, а Утиха Итачи им стал в 13 лет. Морино Ибики (экзаменатор первого испытания Экзамена Чюнин начальник |Команды Пыток и Допросов AНБУ Селения Листвы Коноха АНБУ Го:мон/Дзиммон Бутай. Момочи, Забуза и Райга Куросуки входили в АНБУ Селения Тумана. Как и обыкновенные ниндзя, особая команда работает группами, состоящими из четырёх элементов. Их выбирают, когда они еще находятся на уровне Чюнин, и повышают в звании до уровня капитана.

==== Корень ====
АНБУ из Конохи обычно подчиняются прямым командам Хокагэ, но за несколько лет до первых событий первой части «Naruto», существовал Департамент Подготовки АНБУ известный как '''Корень"нэ, который был основан и непосредственно возглавлен Дандзо. С того момента как Дандзо начал вести военную политику, что противоречило мировоззрению Третьего Хокагэ, Корень был расформирован. Несмотря на это многие ниндзя остались преданны организации; по крайней мере нам известны двое (помимо Дандзо): один из них Сай, вверенный Команде №7 вместе с Узумаки Наруто и Харуно Сакурой во второй части этой манги; второй - его коллега старшего уровня, к которому тот обращается просто как Именные суффиксы в японском языке (сэнпай).

'''Девиз Корня:'''

"Нэ" ни ва... намаэ ва най, кандзё ва най...
В Корне… нет имён. Нет чувств…

Како ва най... мирай ва най. Ару но ва нимму...
Нет прошлого… нет будущего. Существуют только миссии…

Коноха тойу тайбоку о мэ ни миэну ти но нака ёри каэру, варэварэ "Нэ" но иси.
Это воля нас членов Корня, которая из под земли, невидимая для простого глаза, поддерживает это большое дерево называемое

Корень способствует полному устранению эмоций, чтобы дать возможность своим членам доводить до конца миссии не сдерживая себя. Эта организация имеет тенденцию следовать и дальше своим убеждениям: шиноби, в отличие от большинства других групп ниндзя, не должен показывать никаких чувств (из упоминаний Сайя о правилах после того, как у него был найден подарок его «брата»). Считается, что Корень использовал методы, подобные выпускному экзамену Академии Селения Тумана, который включал в себя смертельные поединки между студентами.

Также подразумевалось, что Дандзо вместе с Корнем планировал разрушить Селение Листвы, ища сотрудничество с Орочимару. Но вскоре была доказана неверность этих утверждений, поскольку истинная миссия Сайя состояла в том, чтобы проникнуть в его ряды и убить Учиху Саскэ, таким образом устраняя возможную угрозу для Конохи. Однако, увидев какие дружеские отношения связывают Наруто и Саскэ, юноша отклоняется от плана и решает защитить эту связь.

==== Ниндзя преследователи ====
Хаку в маске ниндзя преследователя.
'''Ниндзя преследователи''' подразделение АНБУ Селения Тумана, их задача состоит в поимке Ниндзя предателей. Они обязаны убить цель и принести голову трупа как доказательство, затем полностью уничтожить тело, креминируя его или скармливая чёрным воронам; за что и были прозванны «Команда Владельцев Похоронного Бюро». Это сделано, чтобы избежать, что другие селения узнают о типе чакры, съеденных лекарственных препаратах,ниндзюцу, медицинских вмешательств и Кэккэй гэнкай индивидуума. Также ниндзя преследователь обязан уничтожить труп на том же самом месте, где он был убит. Как требование, они обучены убивать человека с предельной лёгкостью и должны обладать полными знаниями человеческой анатомии. Вначале сериала, Хаку претворяется одним из этих ниндзя, что бы защитить своего товарища Момочи Забузу, спасая его от Хатакэ Какаши. На сегодняшний день, основываясь на ношение на лице маски (как у Команды Особого Назначения), настоящий ниндзя преследователь пока не был замечен в мире «Naruto».